Ayatuna Quran Academy (AQA)

Sebagai institusi Al-Quran, Ayatuna mengedepankan pendidikan Al-Quran untuk para santri dan memastikan para santri mendapatkan kurikulum Al-Quran yang memadai. Maka lembaga ini bertanggung jawab atas seluruh pelaksanaan program Quraniy yang berada di Pondok Modern Ayatuna. Lembaga ini dipimpin oleh Direktur Quran Academy. Diantara kurikulum yang diajarkan adalah Tahfizh, Tahsin, Tadabbur, Tafsir Al-Quran, Ulum -l- Quran, dan lain-lain.

AQA juga bertanggung jawab atas berjalannya Program Intensif Menghafal Al-Quran. Dikarenakan intensifnya program ini menuntut kesadaran tinggi dan kedewasan para santrinya, maka program ini diikuti oleh santri berusia 17-35 tahun.

Meskipun para santri menghafal untuk jangka waktu yang relatif singkat (1 bulan-1 tahun), AQA mengedepankan kualitas hafalan dengan menegakkan prinsip-prinsip menghafal Al-Quran dan memastikan program ini tetap berjiwa pesantren. Dalam pelaksanaan kegiatan menghafal Al-Quran intensif tersebut, AQA melaksanakan wisuda setiap akhir program, sehingga setiap program terdapat angkatan santri yang bilangannya selalu bertambah.